告别了大吾的几人继续修行
龙虾小兵惹了一只吼爆怪，然后几人终于会合，弗列托斯在墙上开了个洞，逃出了洞穴
然后就和自己的宝可梦分别了
几人开始了寻找同伴的旅程
另一边，宝可梦那边
几只宝可梦冲出了洞穴，遇到了一只长鼻叶
小鹤这边，剩下的宝可梦还有小智的傲骨燕，小刚的弗列托斯，小鹤全员都在。
回到宝可梦那里，几只宝可梦把长鼻叶头上的叶子划出了一道口，长鼻叶呼叫了伙伴进行了正义的群殴，将众宝可梦关进了一个笼子里。不过皮卡丘和水跃鱼没有被关起来
“皮卡，皮卡皮卡！”（把我的同伴放出来）
“勾no，勾no勾no”（不可能，你的同伴就被火焰烧死吧）
天上，去巡查的傲骨燕看见了皮卡丘等宝可梦
火箭队把长鼻叶和皮卡丘抓走了，其它的宝可梦留在原地
小鹤一行终于赶到，先是把笼子打碎，放出了龙虾小兵它们
小鹤本来都掏出喷火龙的精灵球了，但是小智………
“龙虾小兵，对我使用蟹钳锤”
小智首接飞到了火箭队的气球上
“不是哥们？超人啊，都是真新镇的，为啥我不行啊？”
小智把长鼻叶和皮卡丘放了下来
长鼻叶和几人一起将火箭队击飞了。
之前不和的木守宫和龙虾小兵也和好了。
众宝可梦和众人坐在篝火旁，享受着这悠闲的时光。
第二天
小鹤几人开始了新的特训，小刚和小鹤跑在最前，小智和小胜在第二梯队，小遥苦苦跟在后面。
小刚突然停下，几人向远处的山崖上看去，看见了一个白大褂的身影
是小田卷博士，他从山崖上跌了下来，然后落在了一只吼爆兽身上
小田卷说是要在野外做研究，小智和小遥，小胜决定今天就和小田卷博士一起做研究
小刚看着自己辛苦列了半天的训练计划焉了下去。
几人来到一个山洞里，看见了一个房间，在房间里看看，一个小孩回来了，貌似是这里的主人，用土局忍士将几人击退，而火箭队在几人离开后把这里霸占了
小鹤几人从别的山洞走出来，看见了刚才的男孩，询问之后，了解了前因后果
另一边，火箭队
火箭队这里正在指挥土局忍士挖洞，然后出现了溶岩队的人，把火箭队打走，让钻洞机在山洞里开洞。
小鹤这边
小男孩叫做总辉
他说了为什么自己会建立秘密基地，还有自己一次没有赢过宝可梦对战的事
小遥听不下去，开始说教总辉去对战
“姐姐说对战很没有说服力呢”
………
几人回到了秘密基地，发现了一片狼藉和墙上的大洞，于是决定进入洞内。
在洞窟内，海洋队和熔岩队起了冲突，小鹤几人在一旁的洞口中看着
几人问总辉这些是不是抢走土局忍士的人，但是遭到了否认
并得知了那些抢走土局忍士的人带着一只喵喵
而火箭队也在洞口上偷看着
小鹤听到了喵喵，就己经知道是谁了，毕竟丰源哪里来的喵喵
海洋队和熔岩队的人撤退了，接下来就是火箭队和小鹤几人的战斗了
小遥让遁甲茧用丝搞了一条滑索，几人降到了地面
“土局忍士，乱抓！”
总辉终于拿到了自己的第一次胜利
火箭队又飞了出去
在夕阳下，几人道别了总辉
